Евгений Викторович Кунин (Eugene V.Koonin, 26 октября 1956) — ведущий научный сотрудник Национального центра биотехнологической информации Национальной медицинской библиотеки Национальных институтов здравоохранения СШ, Бетесда, штат Мэриленд, США. Является признанным экспертом в эволюционной и вычислительной биологии.

В 1973 году Евгений Кунин получил первую премию на Школьной биологической олимпиаде МГУ среди десятиклассников, которую поделил с Алексеем Кондрашовым[2][3]. В 1978 году закончил кафедру вирусологии биофака МГУ. Там же в 1983 году защитил диссертацию на соискание степени кандидата биологических наук. С 1985 по 1991 годы руководил исследованиями по вычислительной биологии в Институте полиомиелита и Институте микробиологии в Москве. С 1991 года работает в Национальном центре биотехнологической информации. Является редактором секции «Анализ генома» в научном журнале Trends in Genetics (англ.)русск.. Евгений Кунин — главный редактор научного журнала с открытым доступом и открытым рецензированием Biology Direct.

Евгений Кунин является бесспорным лидером по цитируемости среди учёных на постсоветском пространстве. По состоянию на 22 июля 2013 года его индекс Хирша равен 133. Он обладает числом Эрдёша, равным двум.